一.醫政業務
1.醫政(含醫療機構、醫事人員及相關醫政業務)管理。
2.醫事人員開、執、歇、停業、變更登記及支援報備申請。
3.醫療機構(診所、醫事檢驗所、醫事放射所、物理治療所開、歇、停、復業登記申請。
4.密醫查緝，醫療違規廣告管理。
5.老人假牙宣導。
6.弱勢醫療補助申請
二.藥政業務
1. 藥事人員(受聘於藥局、藥商)申請執業執照、停業及註銷執業執照，及報備支援申請。
2. 藥局設立、變更（商號名稱、負責人、營業項目、地址、其他）、停業、歇業、復業申請。
3. 西藥販賣業設立、變更（商號名稱、負責人、營業項目、地址、其他）、停業、歇業、復業申請（需同時申請藥事人員執業登記）。
4. 中藥販賣業設立、變更（商號名稱、負責人、營業項目、地址、其他）、停業、歇業、復業申請（需同時申請藥事人員執業登記）。
5. 醫療器材販賣業設立、變更（商號名稱、負責人、營業項目、地址、其他）、停業、歇業、復業申請
6. 列冊/確具中藥商變更（商號名稱、營業項目、地址、其他）、停業、歇業、復業申請。
7. 領有管制藥品登記證機構之管制藥品銷燬、登記證變更(含停歇業)申請。
8. 管制藥品查核領有管制藥品登記證機構及未領有管制藥品登記證之藥局、西藥販賣業、診所、醫院。
9. 藥商局普查、無照藥商查核。
10. 藥物、醫療器材、化粧品抽驗及標示稽查。
11. 藥物、醫療器材、化粧品廣告查核。
12. 藥政宣導。
三.食品衛生
1.檢舉食品案件處理事項。
2.食品中毒案件處理。
3.餐飲衛生、學校廚房有關食品抽驗及稽查。
4.加水站輔導抽驗業者核備。
5.食品標示之檢查。
6.有關健康食品之稽查及抽驗。
四.營業衛生
1.旅館業、理髮美髮美容業、浴室業、娛樂業游泳業、電影映演業等營業場所之衛生管理。
2.游泳池、三溫暖水質檢測。
3.輔導各營業場所辦理從業人員健康檢查。
4.辦理相關營業場所設立(變更)申請，就權責作現場衛生勘查。
五.職業衛生管理
1.輔導勞工健康檢查指定醫院。
2.輔導事業單位、工廠辦理勞工健檢。
3.事業單位、工廠職場衛生管理。
六.菸害防制稽查
七.為民服務及研考業務